Manual de análisis de supervivencia: curvas de supervivencia y regresión de Cox

Manual de análisis de supervivencia: curvas de supervivencia y regresión de Cox

Author: Rubio, Encarna

Publisher: Prensas de la Universidad de Zaragoza

Published: 2016-10-25

Total Pages: 172

ISBN-13: 8416933049

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El análisis de las curvas de supervivencia y de la regresión de Cox, requiere de técnicas estadísticas cada vez más utilizadas en investigaciones relacionadas con las Ciencias de la Salud. Unas veces, se trata de evaluar la eficacia de nuevos tratamientos ya sea valorando el tiempo de remisión de síntomas, el tiempo que tardan en aparecer efectos secundarios tras dicho tratamiento o la supervivencia que tienen tras la aplicación del mismo. Otras veces, se trata de analizar el tiempo que tardan en aparecer los efectos beneficiosos para la salud de una población, tras la puesta en marcha de un programa de educación sanitaria o de cualquier medida preventiva que se implemente, ya sea a nivel poblacional o en entornos más concretos como, por ejemplo, el laboral. Todos estos estudios tienen en común la variable principal «tiempo de ocurrencia de un evento». El problema de estas técnicas estadísticas es que se apoyan en conceptos teóricos y fundamentos matemáticos ajenos y difíciles de entender por los profesionales dedicados al cuidado de la salud, por eso, este libro dirigido fundamentalmente a ellos es eminentemente práctico, obviando en todo lo posible dichos conceptos. El manual está estructurado en 14 capítulos; en los 6 primeros, se estudia el análisis de supervivencia y el resto se dedica a la regresión de Cox.


Introducción al análisis de supervivencia avanzada

Introducción al análisis de supervivencia avanzada

Author: Juan Carlos Salazar Uribe

Publisher: Editorial Bonaventuriano

Published: 2020-11-02

Total Pages: 239

ISBN-13: 9588474930

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Este libro aparece tras varios años de experiencia dictando el curso Tópicos avanzados de análisis de supervivencia dentro del plan de estudios del doctorado en Ciencias Estadísticas de la Universidad Nacional de Colombia, sede Medellín, y tiene la ventaja de estar escrito en español. El análisis de supervivencia avanzada ha sido ampliamente estudiado en la literatura desde las propuestas de Kaplan y Meier, Nelson, Aalen y Cox. Existen excelentes libros sobre el tema que varían en complejidad, algunos con un enfoque práctico y otros con un enfoque puramente teórico. Este trabajo en particular presenta una introducción al análisis de supervivencia avanzada y se recomienda como material de apoyo para los cursos de posgrado que se relacionen con Estadística. Aunque se requieran conocimientos previos de probabilidad y procesos estocásticos, el texto repasa algunos conceptos necesarios para comprender el análisis de datos de supervivencia. Con este material se pretende discutir y exhibir la fusión entre el análisis clásico de supervivencia y los procesos estocásticos, avance en el área que hace más flexible el manejo de los estimadores de las funciones de supervivencia y de las funciones de riesgo, a la vez que permite estudiar sus propiedades de una manera intuitiva, exhaustiva y apropiada. Finalmente, y a pesar de ser un escrito casi en su totalidad teórico, también se incluyen ilustraciones con datos, a fin de resaltar la utilidad del análisis de supervivencia. En razón de lo anterior, el lector encontrará una guía sobre el uso de programas como Python, R y SAS para implementar el método de Kaplan-Meier, el método de Nelson-Aalen, el log-rank test y el modelo de riesgos proporcionales de Cox.


Análisis multivariante en ciencias de la salud: derivadas unidad didáctica 5. Métodos de estimación unidad didáctica 6. Modelo de regresión simple unidad didáctica 7. Modelo de regresión múltiple unidad didáctica 8. Confusión e interacción unidad didáctica 9. Regresión con variables categóricas, análisis de covariancia unidad didáctica 10. Construcción de un modelo de regresión múltiple con fines predictivos : selección de la mejor ecuación de regresión unidad didáctica 11. Construcción de un modelo de regresión múltiple para evaluar un efecto en presencia de confusión e interacción unidad didáctica 12. Diagnósticos de un modelo de regresión múltiple unidad didáctica 13. Modelo de regresión logística unidad didáctica 14. Construcción de un modelo de regresión logística unidad didáctica 15. Análisis de la supervivencia unidad didáctica 16. Modelos de regresión con datos de supervivencia : modelo de regresión de riesgos proporcionales de Cox

Análisis multivariante en ciencias de la salud: derivadas unidad didáctica 5. Métodos de estimación unidad didáctica 6. Modelo de regresión simple unidad didáctica 7. Modelo de regresión múltiple unidad didáctica 8. Confusión e interacción unidad didáctica 9. Regresión con variables categóricas, análisis de covariancia unidad didáctica 10. Construcción de un modelo de regresión múltiple con fines predictivos : selección de la mejor ecuación de regresión unidad didáctica 11. Construcción de un modelo de regresión múltiple para evaluar un efecto en presencia de confusión e interacción unidad didáctica 12. Diagnósticos de un modelo de regresión múltiple unidad didáctica 13. Modelo de regresión logística unidad didáctica 14. Construcción de un modelo de regresión logística unidad didáctica 15. Análisis de la supervivencia unidad didáctica 16. Modelos de regresión con datos de supervivencia : modelo de regresión de riesgos proporcionales de Cox

Author: José M. Doménech Massons

Publisher:

Published: 1995

Total Pages:

ISBN-13: 9788480490566

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Técnicas no paramétricas y modelos de regresión para datos de tiempo de vida

Técnicas no paramétricas y modelos de regresión para datos de tiempo de vida

Author: Lorena Barrenechea López

Publisher:

Published: 2018

Total Pages: 86

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La característica principal en un estudio de supervivencia es que los sujetos bajo estudio se observan durante un tiempo estipulado, denominado tiempo de seguimiento, y el objetivo es conocer el tiempo en el que tiene lugar el evento o suceso de interés (tiempo de ocurrencia). Dado que este análisis puede aplicarse a distintos campos de investigación, el evento de estudio será el propio de cada disciplina: en medicina puede ser la muerte de un paciente que sufre una patología concreta o bien un episodio relacionado con la enfermedad; en ingeniería puede referirse al fallo de una máquina o de una de sus piezas y en economía podría ser el inicio de un nuevo empleo después de un periodo de desempleo. A lo largo de este trabajo, explicaremos algunas de las técnicas utilizadas para el estudio de supervivencia. En el Capítulo 1, estableceremos algunas definiciones para poder entender las funciones usadas en cada método, y que desarrollaremos en los siguientes capítulos. Hablaremos sobre la censura y el truncamiento, que es una manera de poder continuar con el estudio, cuando un individuo (o una pieza) muere (o falla). Y por último, las técnicas paramétricas que se utilizan. En el Capítulo 2, presentaremos las técnicas no paramétricas que se utilizan cuando los datos no se ajustan a ninguna distribución conocida. Estas técnicas son Kaplan-Meier, Nelson-Aalen y el test Log-Rank. En el Capítulo 3, nos centramos en un modelo en el que además de relacionar la tasa de supervivencia con el tiempo, se añaden diferentes covariables explicativas. Es el denominado modelo de regresión de Cox. Vemos los residuos que se utilizan para comprobar que ese modelo es válido. Por último, introducimos lo que se llama 2modelo de Cox estratificado3 que surge cuando la hipótesis de riesgos proporcionales no se cumple. Finalmente, en el Capítulo 4, utilizamos el software R para aplicar lo expuesto en este trabajo a un conjunto de datos reales.


Modelo lineal generalizado

Modelo lineal generalizado

Author: Manuel Ato García

Publisher:

Published: 2005

Total Pages: 302

ISBN-13: 9788496367203

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El MLG (Modelo lineal generalizado) constituye la generalización natural de los Modelos Lineales clásicos, e incluye como casos particulares la regresión lineal, el análisis de varianza, el análisis de la covarianza, la regresión logit, la regresión de Poisson, los modelos log-lineales, los modelos de respuesta multinomial, así como ciertos modelos de análisis de supervivencia y de series temporales.


Aportaciones en análisis de supervivencia

Aportaciones en análisis de supervivencia

Author:

Publisher:

Published: 2002

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Gran parte de la teoría moderna de análisis de supervivencia se trata mediante procesos de conteo. La importancia de este planteamiento radica en que para un tiempo de supervivencia podemos definir un proceso de conteo a partir del cual, utilizando el teorema de descomposición de Doob-Meyer, se puede enalzar directamente en la teoría de martingalas. Por lo que, debido a este planteamiento, se pueden utilizar unas herramientas muy poderosas, unas relacionadas con la teoría de martingalas y otras con la integración estocástica, que facilitan enormemente el estudio de las propiedades asintóticas de los estimadores de los parámetros, lo que ha permitido un gran avance en el análisis de supervivencia durante los últimos años. Este tratamiento del análisis de supervivencia mediante procesos de conteo tiene sus orígenes en el trabajo de Aalen (1978). Posteriormente Andersen y Gill (1982) integraron el modelo de Cox en el marco de procesos de conteo, generalizando de esta forma el tratamiento habitual de los modelos de supervivencia. En esta memoria, nosotros analizamos algunos modelos de supervivencia, bajo el supuesto de que el proceso de intensidad del proceso de conteo posee estructura multiplicativa. Nos centramos fundamentalmente en el estudio de modelos de riesgo multiplicativo, de riesgo aditivo y de riesgo aditivo-multiplicativo, considerando covariables que varían en el tiempo y diversos tipos de datos de supervivencia. Obtenemos las ecuaciones de verosimilitud y la matriz de información para los parámetros de los modelos y estudiamos propiedades asintóticas para los estimadores, tales como consistencia y normalidad asintótica, para lo que aplicamos las técncias de máxima verosimilitud clásicas junto con las de integración estocástica y el teorema central del límite de Rebolledo para martingalas locales. Nos centramos fundamentalmente en el estudio de los modelos paramétricos y semiparamétricos; el origen de ambos tipos de modelos es el mismo, partiendo de la misma función de verosimilitud, en los modelos paramétricos se supone conocida la forma de la función de riesgo base y en los modelos semiparamétricos se supone desconocida, por lo que se estima el riesgo base acumulado. Un inconveniente de los modelos semiparamétricos es que los estimadores que se obtienen generalmente involucran la función de riesgo base, por lo que la cota de eficiencia no se puede alcanzar completamente. En el primer capítulo se presentan los conceptos básicos que necesitaremos para el desarrollo de esta memoria. En la segunda sección exponemos una revisión de los conceptos relacionados con el análisis de sueprvivencia clásica, tales como la función de riesgo y la función de supervivencia, y algunos otros como censura, truncamiento y covariables. Definimos el proceso de conteo para observaciones censuradas a la derecha como ilustración de la forma de enlazar el análisis de supervivencia con la teoría de procesos. A continuación, recogemos algunos conceptos relacionados con la teorías de procesos, martingalas e integración estocástica, prestando especial atención a las propiedades locales de procesos estocásticos, en particular al concepto de martingala local que será fundamental en el desarrollo de esta memoria. Definimos el concepto de procesos de conteo y presentamos algunas características de éstos, entre la que destacamos el concepto de proceso de intensidad que juega un papel muy similar a la función de riesgo clásica. Presentamos el teorema de descomposición de Doob-Meyer para submartingalas y para submartingalas locales, con sus versiones correspondientes para procesos de conteo. Además también recogemos el Teorema de Rebolledo y la desigualdad de Lenglart en sus versiones para procesos de conteo, junto con algunos conceptos y resultados más de integración estocástica que necesitaremos. Definimos los modelos de intensidad multiplicativa y presentamos la forma de verosimilitud que vamos a utilizar para la estimación de los parámetros. Finalmente se hace una revisión de la bibliografía más destacada en el tema, dentro del contexto de los procesos de conteo. El segundo capítulo lo dedicamos a la construcción de modelos para datos de supervivencia. Analizamos distintos tipos de datos de supervivencia y su relación con los procesos de conteo. Además obtenemos las ecuaciones de verosimilitud para datos de supervivencia en diferentes situaciones y para las distribuciones más utilizadas en análisis de supervivencia. También recogemos las ideas de Borgan (1984) para el estudio de modelos paramétricos sin covariables, presentamos los modelos paramétricos de intensidad multiplicativa de un proceso de conteo general y recogemos las condiciones bajo las cuales Borgan prueba que existe una solución consistente de las ecuaciones de verosimilitud planteadas y que esta solución se distribuye asintóticamente según una ley normal multivariante. Además consideramos los modelos para datos de supervivencia con covariables y planteamos brevemente los diferentes modelos que nosotros vamos a tratar en los siguientes capítulos. En el tercer capítulo consideramos los modelos de riesgo multiplicativo, en donde suponemos que la función de riesgo tiene una estructura multiplicativa, de forma que el proceso de covariables o una función de él, actúa multiplicativamente sobre el riesgo base. Debido a la gran importancia que ha tenido el modelo semiparamétrico de Cox en el análisis de supervivencia, recogemos en primer lugar este modelo en el contexto de los procesos de conteo utilizando las ideas de Anderseny Gill (1982). Este planteamiento se puede considerar la base de todos los demás modelos de supervivencia, tanto en notación como en procedimiento. Recogemos las condiciones bajo las cuales existe un estimador consistente y bajo las que este estimador se distribuye asintóticamente según una ley normal multivariante. En la segunda parte del capítulo consideramos el modelo paramétrico de riesgo multiplicativo tratado brevemente por Borgan y aportamos el estudio de las propiedades asintóticas de los estimadores de los parámetros del modelo. Como alternativa a los modelos de riesgo multiplicativo tenemos los modelos de riesgo aditivo. Lin & Ying (1994) realizan un estudio semiparamétrico de este tipo de modelos. En el cuarto capítulo consideramos un modelo paramétrico de riesgo aditivo, obtenemos las ecuaciones de versomilitud y la matriz de información y estudiamos las propiedades de consistencia y normalidad asintótica de los estimadores. Scheike & Zhang (2000) sugieren un modelo no-paramétrico que combina el modelo multiplicativo y aditivo. En el quinto capítulo proponemos, basándonos en el trabajo de estos autores, un modelo semiparamétrico de riesgo aditivo-multiplicativo y otro modelo paramétrico de riesgo aditivo-multiplicativo. En ambos casos obtenemos las ecuaciones de verosimilitud y la matriz de información. Además demsotramos que se cumplen las propiedades de consistencia y normalidad asintótica de los estimadores.


El Modelo aditivo de Aalen. Una alternativa al modelo de riesgos proporcionales

El Modelo aditivo de Aalen. Una alternativa al modelo de riesgos proporcionales

Author: Itxaso Alayo Bueno

Publisher:

Published: 2016

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El modelo de Cox, basado en la suposición de que las funciones de riesgo entre individuos expuestos a factores distintos se mantiene constante a lo largo del tiempo, es el modelo de regresión más utilizado para tiempos de supervivencia. El modelo aditivo de Aalen es una alternativa al modelo de Cox.A partir de una gran base de datos del Instituto Nacional de Cáncer de Estados Unidos se propone analizar la supervivencia en pacientes de cáncer de leucemia y de linfoma según el modelo de Cox y el modelo aditivo de Aalen.